Организаторы «Дакара»-2016 приняли решение остановить третий этап в зачёте грузовиков, после того как ливневые дожди разрушили часть запланированного спецучастка. Изначально планировалось сократить маршрут, однако погодные условия ухудшались. Мотоциклы, квадроциклы и легковые автомобили успели проехать залитый водой участок после второй контрольной отсечки, однако грузовикам уже было невозможно его преодолеть из-за обрушений, образовавшихся на пути.
Таким образом, для грузовиков это уже второй сокращённый этап из трёх. Ещё один спецучасток был отменён, а пролог — остановлен из-за аварии с участием зрителей. Положение участников зачёта будет распределено по итогам контрольной точки, которую последней успели проехать пилоты.